"Кримският мост е построен по технологиите на куполите на реакторите на АЕЦ", твърди сътрудник от ФСБ, отговорен за безопасността на съоръжението, цитиран от "Российская газета". Това означава, че мостът е способен да издържи и пряко нападение на самолет. От въздушни атаки е защитен чрез ешелонна система за ПВО, представена в пълна линия зенитни ракетни комплекси: от "Панцири" до разположените във Феодосия С-400.
Освен чисто зенитните средства, способни да отразят масирана ракетна или авиационна атака, на бреговете на Керченския пролив са разгърнати и най-новите средства за радиоелектронна борба. При необходимост те прикриват моста с невидим купол срещу радари и самонасочващи се глави на крилати ракети, които объркват апаратурата на бомбардировачите и безпилотните летателни средства.
"Мостът №1" е също толкова добре защитен и от атаки откъм морето. Достъпът до моста по вода и суша денонощно се контролира от отделна бригада на Росгвардия, подкрепяна от граничари и противодиверсионни отряди на Черноморския флот.