Основан през 1864 г., Московският зоопарк е един от най-старите в Европа. Първоначално той е известен като зоологическа градина.
Днес Московският зоопарк се намира в сърцето на столицата, но през 19 в. този район е бил разположен в покрайнините на града. Живописна площ с имения и зелени пространства – любимо място за разходки.
Колекцията от животни в зоопарка често е обогатявана с подаръци от влиятелни личности. Руският император Александър II подарява индийски слон, а Константин Николаевич Романов – носорог. Хедивът на Египет и Судан Исмаил паша подарява на зоопарка зебра.
По време на Гражданската война около 90% от животните умират, но следва възраждане. Във времето на Съветския съюз зоологическата градина навлиза в нова глава от историята си: територията ѝ е разширена, построени са павилиони за обитателите и са придобити нови животни.
През 1935 г. лъвица отхвърля малкото си и служителката в зоопарка Вера Чаплина го взима у дома в комуналния апартамент. Колито ѝ храни лъвчето и толкова се привързва към него, че се налага двете животинки да се върнат заедно в зоопарка.
През 1927 г. зоологическата градина получава името "зоопарк" и става научноизследователски център. Биолози организират конференции, лагери и семинари, започва работа и в новите лаборатории и ветеринарни центрове.
Дори по време на Великата Отечествена война зоопаркът продължава да работи с повече от 6 млн. посетители в периода 1941-1945 г. Повечето животни остават в зоопарка, хранени от служители, които сами умирали от глад.
През 1970-1980-те зоопаркът преминава през тежки времена. Поради липсата на подкрепа от държавата, започва да се запуска и да се разпада. Сградите са в толкова окаяно положение, че главите на амурските тигри много често са удряни от жаби, падащи от терариума отгоре.
Реконструкцията започва през 1990-те под надзора лично на московския кмет Юрий Лужков. Всъщност в началото на 2000-те руската столица се сдобива с изцяло нова зоологическа градина, реконструирана и модернизирана. Днес близо 8 хил. животни от около хиляда вида живеят тук: от огромни слонове до малката шарена къртица, която е дълга само седем сантиметра.
Един от най-запомнящите се обитатели е 81-годишният алигатор Сатурн. Според местните легенди Хитлер обичал да гледа животното по време на визитите си в Берлинския зоопарк, където е живял Сатурн. През 1946 г. животното е транспортирано в Московския зоопарк.