Събор на Светото възкресение (Николай-до), Токио, 1891
Най-известният православен храм в Япония е разположен в оживен район на Токио и е наречен в чест на Николай Касаткин (Николай Японски), руски мисионер от XIX век, който започва неговото строителство. М.А. Шчурупов, професор по архитектура от Санкт Петербург, прави проекта за храма, а В.М. Пешехонов, придворен художник от Санкт Петербург, изрисува иконите за дървения иконостас на три нива.
Камбаните също са докарани от Русия. Храмът е силно повреден при земетресението в Канто през септември 1923 година, което отнема живота на много хора. Камбанарията рухва и пада през купола, а страшен пожар разрушава вътрешността на църквата. За щастие обаче по-късно храмът е възстановен. За първи път през последните 90 години нови камбани, които са отлети в Ярославска област, са монтирани на камбанарията.
Църквата "Възкресение Христово", Хакодате, 1859
Това е първата православна църква в Япония. През 1858 г. тя е построена като параклис за първото руско консулство в Япония. Николай Японски служи тук от 1861 до 1869 година. Заради звука на камбаните му, който е бил толкова необичаен за Япония, местните жители започват да го наричан "Ган Ган-дера" или "Църквата дин-дон". През 1907 г. църквата изгаря до основи по време на опустошителния пожар в Хакодате, но благодарение на Николай Японски на нейно място, малко преди смъртта му, е построена нова църква от тухли.
Благовещенски събор, Киото, 1903
Интериорът на този събор на практика не се е променил от 1903 г. и се отличава с елегантен бял иконостас. В събора има икони на Николай Чудотворец, подарени от руски военнопленници, които са били тук по време на руско-японската война, а също и реликви, подарени от Йоан Кронщадски.
Църквата "Преображение Господне", Сапоро, 1971
Тази църква може да се гордее с най-голямата колекция от икони на японската иконописка Ямашита Рин (1857-1939, кръстена Ирина). Рин произхожда от семейство на самураи и е първата японка, която се учи в Русия, където овладява тънкостите на иконописта в работилницата за икони на Санкт Петербург. През живота си Рин е създала много творби, включително и иконата, която е подарена на престолонаследника Николай Александрович по случай визитата му в Япония през 1891 година. Нейни работи могат да се видят в много православни църкви из цяла Япония.
Църквата "Свети апостол и евангелист Матей", Тойохаши, 1915
Църквата "Свети апостол и евангелист Матей" в префектурата Аичи изпъква благодарение на интересните архитектурни детайли. Например, декорът на части от фасадата, където пиластърът се пресича с вертикалната колона, е характерен за традиционния японски стил. Интересен факт е, че тази църква е била построена от същия архитект, който е създал и църквата в Хакодате, Моисей Кавамура.
Църква "Свето Богоявление", Нагоя, 2010
Първата постройка на тази църква, издигната през 1913 година, изгаря до основи при въздушно нападение по време на Втората световна война. Новата каменна църква е изградена в традиционен руски стил и напомня средновековните храмове в Суздал.
Църквата "Слизането на Светия Дух", Токошима, 1980
Църквата е разположена на остров Шикоку, традиционна будистка крепост. Тук също могат да се видят икони на Ямашита Рин.
Източноправославна църква в Чузенджи, светилище Кеней, полуостров Идзу, 1912
Полуостров Идзу, известен сред туристите със своите горещи термални извори, има и православна църква. Тя е построена през 1912 г. само за три месеца и половина. По това време Николай Японски вече е сериозно болен и местните вярващи се опитват колкото се може по-бързо да построят църквата, за да се молят за неговото здраве. В храма са монтирани иконостасът и полилеят от бившата военна църква в Порт Артур. Тук също могат да се види изображение на разпятието на Ямашита Рин.